代理記賬行業(yè)蓬勃發(fā)展的同時，也有存在一些問題需要逐漸完善，目前主要是有以下幾個問題：

1．對于《會計法》代理記賬的宣傳力度不夠，造成許多小型經(jīng)濟組織、特別是廣大的個體工商戶，對“代理記賬”知之甚少，認識不足，理解不夠。

2．對于“代理記賬”的措施不是很得力。當前對于應當委托代理記賬的小型經(jīng)濟組織和應當建賬的個體工商戶而言，主要存在兩方面的問題，一是應當建賬而不建賬的現(xiàn)象十分普遍，二是許多“受托代理記賬人”不具備合法資格。這不僅干擾了法律的嚴肅性，而且容易派生出許多其他問題。

3．在代理記賬法律關(guān)系中，受托人的法律地位問題，應該說一直沒有得到徹底的解決，實踐中爭議很大。

4.代理記賬機構(gòu)潛力未充分發(fā)揮。代理記賬機構(gòu)的數(shù)量在不斷增加，但整體規(guī)模普遍較小，代理業(yè)務范圍不寬。真正能提供受托單位會計核算、稅收籌劃、納稅申報、內(nèi)部審計、工商稅務注冊年檢、財稅咨詢等全方位會計服務的機構(gòu)很少。

5.代理記賬機構(gòu)設立不規(guī)范。代理記賬機構(gòu)必須有3名以上持有會計從業(yè)資格證書的專職從業(yè)人員，且主管代理記賬業(yè)務的負責人必須具有會計師以上專業(yè)技術(shù)職稱資格。但實際執(zhí)行中，相當部分的代理記賬機構(gòu)不符合此規(guī)定。

6.代理記賬機構(gòu)內(nèi)部管理混亂。實際執(zhí)行中很多代理記賬業(yè)務操作不規(guī)范、內(nèi)部管理制度不健全現(xiàn)象十分普遍，部分代理記賬機構(gòu)的內(nèi)部管理制度即使制定也是形同虛設。

7.代理記賬機構(gòu)執(zhí)業(yè)質(zhì)量不樂觀。會計核算方面尚存在許多不規(guī)范之處，一些會計核算未能以權(quán)責發(fā)生制為基礎(chǔ)，對所代理公司未按《公司法》計提法定公積金、法定公益金的現(xiàn)象也較普遍，代理編制的年度財務會計報告都只有基本會計報表，均未按制度規(guī)定的要求提供會計報表附注的內(nèi)容等。

8.是代理記賬業(yè)務收費標準混亂。在收費標準上，各家代理記賬機構(gòu)懸殊較大，有些代理記賬機構(gòu)甚至通過低價進行惡意競爭，還有部分代理記賬機構(gòu)自身的經(jīng)營收入核算不規(guī)范，隱匿收入現(xiàn)象也較普遍。

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