單一法人企業(yè)相比，企業(yè)集團除內(nèi)部治理具有一定的特殊性外，在利用市場進行治理方面也具有一定的特殊性。
首先是產(chǎn)品市場的特殊性。企業(yè)集團內(nèi)部成員企業(yè)通過資本、人事、授術、契約等聯(lián)結紐帶，形成相對穩(wěn)定、長久的交易關系，其外部產(chǎn)品市再場競爭性較單體企業(yè)弱，但成員企業(yè)之間因獨立的法人地位而存在一定程度的競爭。集團內(nèi)部及集團與外部企業(yè)之間的競爭對集團整體及各成企業(yè)造成很強的壓力和動力，外部競爭所提供的選擇性、激勵及約束促集團成員企業(yè)進一步加強合作。
其次是經(jīng)理人市場的特殊性。外部經(jīng)理市場對企業(yè)集團母公司和司經(jīng)營者都具有約束作用，即公司經(jīng)營者均是由投資者通過董事會理人市場選擇的結果。其特殊性在于，子公司經(jīng)理層的選擇在具體操上更加復雜，具體來說就是選擇子公司經(jīng)理的職責由母公司而非子公司自己來承擔。母公司按照經(jīng)理人市場的評價標準，在潛在競爭者（多集團內(nèi)部的優(yōu)秀管理人員）中進行選擇，并按經(jīng)理人市場的要求對被選者進行考核、監(jiān)督和激勵。

再次是控制權市場的特殊性。外部控制權市場很難對集團經(jīng)營者起應有的治理作用，其原因主要是，外部投資者與集團的股東一樣，也面著較單一法人公司嚴重的信息不對稱。對相互持股的財團型企業(yè)集團而言，由于其成員企業(yè)的多數(shù)股票在與自己有長期合作利益且友好的對象手中，股票流動率很低，且股權集中，敵意接管的潛在威脅母子公司制企業(yè)集團的子公司而言，由于母公司掌握其控股權，可以利用人事任命來約束其經(jīng)營者，而且不會任由子公司被其他企業(yè)接管，因此，公司控制權市場對子公司經(jīng)營者的約束相對較弱。
總之，企業(yè)集團治理不但要解決一般公司治理所關注的委托一代理問題，而且要解決成員企業(yè)之間的交易費用問題。企業(yè)集團治理是超越多個企業(yè)法人實體的治理，這些法人實體首先是一個個獨立的企業(yè)，并用資產(chǎn)或契約為聯(lián)結路徑形成一個經(jīng)濟聯(lián)合體，對企業(yè)集團的治理既要通過股東會、董事會、監(jiān)事會和經(jīng)理層等權力機構的設置以及其他控制和激勵機制的設計，解決企業(yè)集團內(nèi)部成員企業(yè)面臨的委托一代理問題，還要通過資本、人事和契約等聯(lián)結紐帶，運用多種控制手段，協(xié)同好集團內(nèi)部成員企業(yè)間的關系，特別是母子公司之間的關系，以發(fā)揮整體協(xié)同優(yōu)勢。