在計(jì)算土地增值稅應(yīng)納稅額的時(shí)候，應(yīng)當(dāng)先用納稅人取得的房地產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入減除有關(guān)各項(xiàng)扣除項(xiàng)目金額，計(jì)算得出增值額。再按照增值額超過扣除項(xiàng)目金額的比例，分別確定增值額中各個(gè)部分的用稅率，依此計(jì)算各部分增值額的應(yīng)納土地增值稅稅額。各部分增值額應(yīng)納土地增值稅稅額之和，即為納稅人應(yīng)納的全部土地增值稅稅額。
應(yīng)納稅額計(jì)算公式：
應(yīng)納稅額=∑（增值額×適用稅率）
另有一種簡(jiǎn)便計(jì)算方法，公式如下：
一、增值額不超過扣除項(xiàng)目金額50%的：
應(yīng)納稅額=增值額x30%
二、增值額超過扣除項(xiàng)目金額50%，不超過100%的：
應(yīng)納稅額=增值額x40% -扣除項(xiàng)目金額X5%
三、增值額超過扣除項(xiàng)目金額100%，不超過200%的：
應(yīng)納稅額=增值額x50% -扣除項(xiàng)目金額x15%
四、增值額超過扣除項(xiàng)目金額200%的：
應(yīng)納稅額=增值額x60% -扣除項(xiàng)目金額x35%
房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)有下列情形之一的，稅務(wù)機(jī)關(guān)可以參照與其開發(fā)規(guī)模和收入水平相近的當(dāng)?shù)仄髽I(yè)的土地增值稅稅負(fù)情況，按照不低于預(yù)征率的征收率核定征收土地增值稅：
一、按照法律、行政法規(guī)的規(guī)定應(yīng)當(dāng)設(shè)置賬簿但是沒有設(shè)置賬簿的；
二、擅自銷毀賬簿，拒不提供納稅資料的；
三、雖然設(shè)置賬簿，但是賬目混亂或者成本資料、收入憑證、費(fèi)用憑證殘缺不全，難以確定轉(zhuǎn)讓收入或者扣除項(xiàng)目金額的；
四：符合土地增值稅清算條件，沒有按照規(guī)定的期限辦理清算手續(xù)，經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)責(zé)令限期清算，逾期仍然不清算的；
五、申報(bào)的計(jì)稅依據(jù)明顯偏低，又無正當(dāng)理由的。
土地增值稅稅額以人民幣為計(jì)算單位。納稅人轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)取得的收人為人民幣以外的貨幣的，應(yīng)當(dāng)先按照取得收入當(dāng)天或者當(dāng)月1日的匯價(jià)折算成人民幣，然后計(jì)算繳納土地增值稅。